因为水警在分利益的时候，被忽视了。。
廉政公署抓的不是黑帮，是黑警。。。四大家族当时也不是所谓的黑社会，而是贵族，黑社会在廉政公署这个电影里面只是最低级的打手，完全听四大探长的，否则一天都混不下去。
雷洛建立的“分钱体系”中，对于水警的需求不高。
在第一版的廉政公署里面，有水警头目跟雷洛谈判的环节，跟水警相关的只有毒品和偷渡。
水警头目放话说要抄尽毒品，结果失败了，两边就结下了梁子。（客观水警弱，编制很少，而且水警抓到的人要交给法院审判，法院也是雷洛的人，但是水警有重武器）
还有一个情节是，水警抓了黑社会的毒贩，抓捕过程中死了水警，雷洛很生气：抓了就抓了，我自然能保你没事，你现在杀了警察，我怎么给你擦屁股！
但是最后还是用钱“摆平”了这件事，问题就是，哪怕水警家属不闹了，水警本身你摆不平啊。
所以廉政公署成立以后，想要寻找武力支援的时候，（在比较早的版本中，都有廉政公署被集体谋杀的情节，但是正是这次集体谋杀，让水警看到了起事的机会）水警就站出来了。
后来的版本，不知道为什么都弱化了水警出现的动机和内容。
廉署当时已经发现警察系统被黑社会分子渗透成筛子了，而且大部分黑警集中于几大警署，尤其是反黑部门。
仓库里猫已经被老鼠喂饱了，怎么还能指望他们去抓仓库里的老鼠。 这时你突然发现院子里负责防范小偷而一直被忽视的狗子似乎还有一定的战斗力～
补充回答： 其实看过A计划的人都会有印象，那就是香港水警和陆警之间存在很严重的矛盾，其矛盾之深虽然没有小日子过得不错的岛上的海陆之争那么严重，但自然不算小。
水陆主要矛盾包括但不限于辖区管辖，执法权分配，经费分配，以及在警队内部的地位高低等等。 尤其是水警在二战后的多次升级，获得了大量装备和人员的扩充，人员编制翻了好几番，逐步获得了西贡半岛，大屿山等地区的管辖权，并升格为一个独立的水警总区之后，与陆警的矛盾愈发激烈。
加上水警为了打击走私和非法入境，投入了大量的经费扩充和更换船艇，并在香港沿岸建立各种行动基地和成立各种特殊任务小组，这无疑极大地挤占了陆警的经费。 既然大家关系这么差，让水警去捉陆警的短处，他们会不乐意么？
